Далее я начала изготовление макетов, по инструкции заказчика

Алина, мне конечно желательно видеть полный текст договора и пункты. Но исходя из того что вы прислали, и написали могу сделать следующие рекомендации: 

Угрозы заказчицы — в основном эмоции. Реальных оснований обвинить вас в мошенничестве у неё нет.

1. Про «прокуратуру» и «мошенничество»

Мошенничество (ст. 159 УК РФ) — это хищение через обман с умыслом не исполнять обязательства. У вас всё наоборот:

вы заключили договор, провели 2 съёмки, отправили фото, делали макеты;
макеты согласовывались с заказчицей, что подтверждает переписка;
вы предложили вернуть часть денег и передать материалы.
Это поведение добросовестного исполнителя, а не мошенника. Никакого умысла на хищение нет. Жалоба в прокуратуру по 159-й, скорее всего, закончится отказом в возбуждении дела — это гражданско-правовой спор, а не уголовка. Так что эта угроза больше для давления.

Прокуратура/полиция в таких случаях обычно отвечают: «обращайтесь в суд в порядке гражданского судопроизводства».

2. Что реально может сделать заказчица

Подать гражданский иск как потребитель (договор прямо ссылается на Закон «О защите прав потребителей», п. 6.1). Тут важно понимать расклад:

В вашу пользу работает договор:

п. 4.1 — вторая съёмка до 20 мая, а отбор фото она прислала 04.06 вместо 18.05 — сроки сорвала именно она;
п. 4.2 — срок сдачи отсчитывается «после согласования всех материалов и макетов». Раз материалы для страниц «летопись» и «история школы» она не предоставила, срок сдачи в принципе не наступил. Значит, обвинять вас в просрочке нельзя;
п. 8.3 — переписка ведётся в мессенджере Макс и по почте — ваша переписка является надлежащим доказательством согласования макетов. Это очень важный пункт в вашу пользу;
п. 8.1 — изменения только письменно и по обоюдному согласию — привлечение дизайнера за ваш счёт без письменного допсоглашения юридически ничтожно, платить вы не обязаны.
Алина, также есть  риски:

п. 5.1 — работы считаются принятыми только после согласования финального макета и подписания акта. То есть формально «полная приёмка» не состоялась. Но это работает и в обе стороны: раз приёмки не было, и о просрочке речи нет, ведь срок завязан на согласование всех материалов;
как потребитель она может потребовать полный возврат при отказе от договора, но по закону (ст. 32 ЗоЗПП, ст. 717, 782 ГК РФ) вы вправе удержать фактически понесённые расходы — а вы реально провели 2 съёмки и сделали макеты. Поэтому ваше предложение вернуть 47 500 ₽ (за вычетом выполненного) — справедливое и законное.

Противоречие в фразе про возврат у вас в претензии:  У вас написано: «готова вернуть часть оплаты за вычетом стоимости фактически выполненных работ, а именно 56 000 руб.». Получается, будто вы возвращаете 56 000, хотя это стоимость вашей работы. Исправьте на:

«готова вернуть часть оплаты за вычетом стоимости фактически выполненных работ (56 000 руб.), а именно 47 500 руб.»

3. Что делать дальше: Не вступайте в перепалку. Вы правы, что перешли на почту. На оскорбления и угрозы не реагируйте эмоционально — это её слабая позиция, не ваша.

Сохраните и заверьте переписку (нотариально или хотя бы скриншоты с датами). Особенно — согласование макетов и её сообщение про отбор фото от 04.06.
Зафиксируйте отказ от договора. Вы уже направили письмо на почту —это! отлично, по п. 8.3 это надлежащий способ. Договор считается прекращённым с момента, когда она его получила.
Подготовьте акт и расчёт на возврат 47 500 ₽ и предложите перечислить по реквизитам. Это покажет вашу добросовестность — если дойдёт до суда, судья это оценит.
Если она обратится в прокуратуру/полицию — спокойно дайте объяснение, приложите договор и переписку. С большой вероятностью будет отказ в возбуждении дела.
Если подаст иск — у вас сильная доказательная база. К заседанию стоит подключить юриста очно.

Хочу понять, права ли я, какие мои дальнейшие действия.

Заказчик может требовать возмещения расходов, понесенных ею на исправление результата работы ( качества оказанной услуги) третьим лицом, однако, если недостатки не были обнаружены, Вы в соответствии с условиями договора выполнили работу качественно, Вы имеете право отказать ей в удовлетворении этого требования. В связи с изложенным, Вы не обязаны оплачивать работу третьего лица ( Дизайнера). 

Также, как Вы указываете, если Заказчик не исполнил встречную обязанность по договору, в соответствии со ст. 328 ГК РФ, Вы имели право на приостановление оказания услуг по договору, согласно  ст. 719 ГК РФ. 

Также, если иное не установлено Вашим договором, Вы имеете право, в соответствии с ч. 2 ст. 719 ГК РФ отказаться от исполнения договора. 

2. Если иное не предусмотрено договором подряда, подрядчик при наличии обстоятельств, указанных в пункте 1 настоящей статьи, вправе отказаться от исполнения договора и потребовать возмещения убытков.

В связи с изложенным, также, необходимо смотреть условия Вашего договора в этой части. 

Если же на данных момент, Заказчик так и не исполнил встречную обязанность по договору в полном объеме, то Вы имеете право на приостановление работ по договору, об этом Вам необходимо направить уведомление. Также, если иное не указано в договоре, Вы имеете право на односторонний отказ по договору. 

К отношениям по возмездному оказания услуг применяются положения о подряде. 

Сейчас, Вы имеете право не удовлетворять требование Заказчика об оплате услуг Дизайнера. 

Также, Вы имеете право на оплату уже оказанных Вами услуг по договору, в соответствии с ч. 2 ст. 781 ГК РФ