Докладная сама по себе взысканием не является - это только служебная фиксация факта для внутренней проверки, а наложить дисциплинарное взыскание работодатель вправе лишь при доказанном нарушении конкретной обязанности, закреплённой в локальном акте (ст. 192-193 ТК РФ).
Обязанность проходить медосмотр действительно установлена ст. 214 ТК РФ, а без прохождения осмотра работодатель не имеет права допускать к работе - ст. 34 закона № 52-ФЗ. Но закон говорит о самом факте прохождения осмотра и подтверждении отсутствия противопоказаний, а не о том, что именно оригинал документа должен физически лежать у работодателя. По порядку проведения медосмотров заключение обычно оформляется сразу в нескольких экземплярах, каждый со своей подписью комиссии - один вручается работнику, второй направляется работодателю напрямую медорганизацией. То есть в норме работодателю не нужен именно Ваш личный экземпляр, у него есть свой.
Тут важный нюанс: если в правилах внутреннего трудового распорядка или положении о медосмотрах у вас на предприятии прямо написано, что работник обязан сдать оригинал заключения в отдел кадров - тогда докладная может стать основанием для выговора. Если такого пункта нет - требование неформальное, и наказание за него можно оспорить. Плюс само медзаключение содержит сведения о здоровье - это специальная категория персональных данных, и хранение оригинала работодателем без письменного согласия работника само по себе спорно.
Получите конкретный план действий по ситуации: что сделать дальше, какие документы подготовить и на какие сроки ориентироваться.