Здравствуйте.
Действительно, в силу положений ст. 209 Гражданского кодекса РФ:
ГК РФ Статья 209. Содержание права собственности
1. Собственнику принадлежат права владения, пользования и распоряжения своим имуществом.
2. Собственник вправе по своему усмотрению совершать в отношении принадлежащего ему имущества любые действия, не противоречащие закону и иным правовым актам и не нарушающие права и охраняемые законом интересы других лиц…
3. Владение, пользование и распоряжение землей и другими природными ресурсами в той мере, в какой их оборот допускается законом (статья 129), осуществляются их собственником свободно, если это не наносит ущерба окружающей среде и не нарушает прав и законных интересов других лиц.
Для квалифицированной дачи рекомендаций по использованию спорного имущества, нужно удостовериться в вашей исключительной правомочночности. Необходимо предоставить информацию о правах сторон на земельный участок и строение, в котором расположен колодец (свидетельства о праве собственности; план земельного участка с закрепленными на местности границами, однозначно свидетельствующий о его принадлежности конкретному лицу и проч.)
Согласно статье 304 Гражданского кодекса Российской Федерации
В силу п. 47 Постановление Пленума Верховного Суда РФ N 10, Пленума ВАС РФ N 22 от 29.04.2010 «О некоторых вопросах, возникающих в судебной практике при разрешении споров, связанных с защитой права собственности и других вещных прав»
Таким образом, вы вправе не пускать соседа в вашу постройку, в случае нарушения ваших прав, можете обратиться с исковым заявлением в суд.