Здравствуйте!
Федерального правила, по которому одно юридическое лицо может зарегистрировать в одном МРЭО не больше двух автомобилей в день, не имеется. Если сотрудники МРЭО указывает такое ограничение, просите письменный обоснованный отказ.
На основании п. 7 Постановления Правительства РФ от 21.12.2019 № 1764:
Заявление о совершении регистрационных действий может быть подано с использованием федеральной государственной информационной системы «Единый портал государственных и муниципальных услуг (функций)» (далее — Единый портал). При направлении в электронном виде заявления и прилагаемых к нему документов, в том числе созданных на Едином портале в электронной форме, они подписываются заявителем — физическим лицом при соблюдении условий пункта 2.1 Правил определения видов электронной подписи, использование которых допускается при обращении за получением государственных и муниципальных услуг, утвержденных постановлением Правительства Российской Федерации от 25 июня 2012 г. N 634 «О видах электронной подписи, использование которых допускается при обращении за получением государственных и муниципальных услуг», простой электронной подписью или, во всех остальных случаях, усиленной неквалифицированной электронной подписью, сертификат ключа проверки которой создан и используется в инфраструктуре, обеспечивающей информационно-технологическое взаимодействие информационных систем, используемых для предоставления государственных и муниципальных услуг в электронной форме, в установленном Правительством Российской Федерации порядке либо усиленной квалифицированной электронной подписью.
www.kontur-extern.ru/info/normativ/document/1/501558-postanovlenie-pravitelstva-rf-ot-21-12-2019-n-1764
То есть указано именно «может быть», а не «подается исключительно через Госуслуги».
Порядок приема подробнее установлен Административным регламентом, утвержденным приказом МВД России от 21.12.2019 № 950.
www.kontur-extern.ru/info/normativ/document/1/501632-prikaz-mvd-rf-ot-21-12-2019-n-950
Согласно п. 23 указанного регламента (утв. приказом МВД России от 21.12.2019 № 950):
Заявления принимаются сотрудниками регистрационных подразделений в течение всего времени, установленного графиком приема в регистрационном подразделении.
Прием заявителей осуществляется в соответствии с очередностью предварительной записи, сформированной с учетом заявлений, поданных с помощью Единого портала, и заявок системы управления электронной очереди и иных электронных систем управления движением заявителей, реализованных в регистрационных подразделениях.
При неявке заявителя в установленное время срок его ожидания составляет не более 15 минут, по истечении которого прием заявителя и оформление документов осуществляются в общем порядке.
Таким образом, сам по себе факт отсутствия регистрации через Госуслуги не означает, что регистрация является незаконной. Более того, п. 63 того же регламента (утв. приказом МВД России от 21.12.2019 № 950) предусматривает:
Основанием для начала административной процедуры является обращение заявителя в регистрационное подразделение с заявлением и документами, предусмотренными пунктом 27 Административного регламента, или получение заявления о предоставлении государственной услуги с помощью Единого портала с приложением документов в электронной форме.
Из этого следует, что сотрудник МРЭО может принять Ваши заявления без записи на Госуслугах, если прием осуществляется в пределах установленного порядка и фактически имеется возможность принять заявителя.
Но в п. 32.5 приказа МВД России от 21.12.2019 N 950 говориться не об ограничении по числу регистрируемых одновременно транспортных средств, а о количестве одновременно подаваемых заявлений по которым не оказана услуга.
При регистрации одного транспортного средства заявитель в этот же день может подать заявление на регистрацию другого и так до бесконечности. Ограничено лишь одновременная подача определенного числа заявлений, а не числа регистрируемых ТС.