Про 58 ГК РФ понятно, но в данной ситуации?

Здравствуйте Вера 

Кроме того в офисе сотрудников фактически не было, (располагались в другом городе).

Это не имеет значение у них как правило свои коэффициенты в договоре которые определяются квадратурой помещения и типом использования помещения. Обязанность уплачивать возникает каждый месяц вне зависимости от того выкидывали вы отходы или нет.  В теории у прошлого ооо заключён был договор по нему и начисляли задолженность. Скорее всего вы не уведомили регионального оператора о смене собственника. Тут можно конечно указывать, что региональный оператор не уведомлял о задолженности но суды редко рассматривают данный аргумент так как согласно ст 210 гк

Собственник несет бремя содержания принадлежащего ему имущества, если иное не предусмотрено законом или договором.

Ниже приложил судебную практику возможно она будет вам полезна 

Вера надеюсь смог вам помочь 

С уважением Давидьянц А.Г.

Здравствуйте! Вы верно указали статью 58 ГК РФ именно на основании данной статьи Вы являетесь правопреемником, поэтому требования адресованы в адрес Вашего юридического лица.

 Обязано ли основное ЮЛ сейчас оплачивать эту задолженность?

Да обязаны. Суд удовлетворить их исковые требования.

Кроме того в офисе сотрудников фактически не было, (располагались в другом городе).

Данное обстоятельство никак не снимает обязанности платить за вывоз ТКО, даже если отходы фактически не производятся.

Договор на оказание услуг по вывозу мусора должен заключаться всеми юридическими лицами без исключения. Если юр.лицо уклоняется от заключения  договора на вывоз мусора, то он считается заключенным в одностороннем порядке.

Статья 24.7. Договор на оказание услуг по обращению с твердыми коммунальными отходами Федеральный закон от 24.06.1998 N 89-ФЗ