Скоро поеду опять пробовать ставить - какие мои действия если не будут ставить?

Здравствуйте, Алексей!

Отказ в постановке на учёт тс.

Постановка транспортных средств на государственный учет, предусмотрена Административным  регламентом МВД РФ, предоставления государственной услуги по регистрации транспортных средств" утвержденного Приказом  МВД России от 21.12.2019 N 950 

122. Постановка транспортных средств на государственный учет осуществляется в соответствии со статьей 17 Федерального закона в порядке, установленном пунктами 28 - 37, 47 - 49 Правил.

В стс и птс год 1988 а кузов 1999

Из чего можно сделать вывод, что у транспортного средства имеются  несоответствие  идентификационного номера ТС с регистрационным номером в документах.  

Федеральным  законом  от 03.08.2018 N 283-ФЗ  «О государственной регистрации транспортных средств в Российской Федерации», установлены основания для отказа в совершении регистрационных действий

Статья 20.

4) в случае несоответствия регистрационных данных или конструкции транспортного средства сведениям, указанным в документах, идентифицирующих транспортное средство, за исключением регистрационных и иных данных транспортного средства, подлежащих изменению (внесению в документ, идентифицирующий транспортное средство) на основании представленных документов;

. К регистрационным данным транспортного средства относятся: 

статья 11
5) идентификационный номер транспортного средства либо идентификационный номер основного компонента транспортного средства в случае, если транспортное средство не имеет идентификационного номера транспортного средства;

Таким образом, отказ в постановке на учет транспортного средства, связан с несоответствием идентификационного номера ТС с регистрационным номером в документах.  

И правомерны ли их действия ?

Насколько я понял из Вашего вопроса, несоответствие идентификационных  номеров,  связано с заменой кузова. Поэтому  отказ в совершении регистрационных действий, является законным. 

какие мои действия если не будут ставить ? 

Исходя из  Административным регламента, Вам необходимо будет получить свидетельства о соответствии транспортного средства с внесенными в его конструкцию изменениями требованиям безопасности.

129.1. Изменение регистрационных данных транспортного средства, связанное с внесением изменений в конструкцию зарегистрированного транспортного средства, производится на основании свидетельства о соответствии транспортного средства с внесенными в его конструкцию изменениями требованиям безопасности.

Если будут вопросы, задавайте мне их в чате сайта.

Удачного вам дня!