Здравствуйте, Юлия!
Честно говоря вообще непонятно, по какой причине суд принял решение о восстановлении на работу, если Вы никак не были уведомлены о ее беременности.
В настоящий момент, если выяснилось, что она не беременна, означает, что к ней не применяются гарантии, предусмотренные ст. 261 Трудового кодекса.
ТК РФ Статья 261. Гарантии беременной женщине и лицам с семейными обязанностями при расторжении трудового договора
Расторжение трудового договора по инициативе работодателя с беременной женщиной не допускается, за исключением случаев ликвидации организации либо прекращения деятельности индивидуальным предпринимателем.
Соответственно, сейчас Вы можете обжаловать судебное решение по причине вновь открывшихся обстоятельств.
ГПК РФ
Статья 392. Основания для пересмотра судебных постановлений, вступивших в законную силу (по вновь открывшимся или новым обстоятельствам)
1. Судебные постановления, вступившие в законную силу, могут быть пересмотрены по вновь открывшимся или новым обстоятельствам.
3. К вновь открывшимся обстоятельствам относятся:
1) существенные для дела обстоятельства, которые не были и не могли быть известны заявителю;
Соответственно, Вам нужно подготовить письменную жалобу для отмены первоначального решения суда, которое состоялось не в Вашу пользу.
Так как сейчас беременности нет возможно ее уволить за те же дисциплинарные взыскания?
Юлия, если беременности нет сейчас, то можно найти основание для увольнения в виде дисциплинарных взысканий. При этом, гарантии по ст. 261 ТК РФ на нее уже распространяться не будут и Вы сможете ее уволить на общих основаниях.