Здравствуйте!
Если я Вас верно понимаю, то заключение по категории годности Д еще не утверждено вышестоящей ЦВВК. В этом случае, к сожалению, заключение ВВК будет действовать лишь с момента его утверждения вышестоящей ЦВВК (п. 8 Положения о ВВЭ, утвержденного постановлением Правительства РФ № 565 от 2013 г.).
Заключение военно-врачебной комиссии о категории годности к военной службе… в военное время действительны с даты их утверждения вышестоящей военно-врачебной комиссией в течение года после окончания периода мобилизации, периода действия военного положения...
Поэтому, формально, процедура увольнения с военной службы может быть начата только после утверждения заключения ВВК и получения его воинской частью.
Кроме того, в любом случае, госпиталь не может заниматься процедурой увольнения с военной службы. Этим занимается командир воинской части, и, формально, присутствие военнослужащего может быть необходимо для сдачи дел и должности, имущества и иных мероприятий (п. 16 ст. 34 Положения о порядке прохождения военной службы).
При этом, супруга должны освободить от исполнения обязанностей военной службы до периода увольнения с военной службы (п. 66 Положения о ВВЭ).
66. В случае если военнослужащий, проходящий военную службу по контракту, признан не годным к военной службе, военно-врачебная комиссия одновременно с заключением о его негодности к военной службе выносит заключение о необходимости предоставления освобождения на срок до дня исключения военнослужащего из списков личного состава воинской части.
Что касается обеспечения лекарственными препаратами — супруг в любом случае, пока он не уволен, госпиталем и командованием воинской части должен быть обеспечен необходимыми лекарствами и иными медицинскими средствами в связи с наличием указанных Вами в вопросе заболеваний. Он вправе обратиться к лечащему врачу за получением необходимых лекарств.