Здравствуйте.
Просто "вернуть" деньги в СФР, чтобы они полежали там до продажи квартиры, законом не предусмотрено - такой процедуры добровольного возврата средств при исполненной сделке нет ни в ст. 10 ФЗ № 256-ФЗ, ни в правилах СФР. Раз ипотека закрыта и доли детям выделены, обязательство по маткапиталу считается исполненным, а само право - реализованным (ст. 7 ФЗ № 256-ФЗ).
Проблема тут не в возврате денег, а в том, что квартира уже находится в долевой собственности детей. Продать её просто так не получится - нужно разрешение органов опеки, и опека потребует либо выделить детям равнозначные (или большие) доли в новом жилье, либо перечислить их долю деньгами на детский счёт. То есть Ваша логика "верну деньги в СФР, а потом решу с квартирой" юридически не работает - сначала нужно разбираться именно с продажей и соблюдением прав детей, а не с самим капиталом.
Технически СФР деньги обратно не принимает вне ситуаций расторжения сделки. Но есть рабочий вариант через одновременную продажу-покупку с сохранением или улучшением условий для детей - и вот тут действительно можно выстроить схему так, чтобы избежать отказа опеки и заодно решить вопрос с остатком неиспользованного капитала (если он был использован не полностью).
Получите конкретный план действий по ситуации: что сделать дальше, какие документы подготовить и на какие сроки ориентироваться.