У меня возник конфликт с работодателем по следующей причине: график работы был составлен таким образом, что

С учётом моего ответа выше далее:

… и покинул рабочее место, мотивируя это тем, что день пути является заранее запланированым нерабочим днем. Теперь работодатель требует объяснительную....

И имели на это полное право в силу положений трудового законодательства РФ.

Касательно требования объяснительной от работодателя, Вы можете её дать и сослаться в ней на положения закона приведённые мной выше, то что работодатель с нарушением определил время смены, за что предусмотрена административная ответственность, и в случае неправомерного привлечяения Вас к дисциплинарной ответственности Вы её оспорите в увстановленном законом порядке.

Во вложении к ответу типовая форма рекомендованная Рострудом РФ.

Далее я продолжу в следующем ответе ниже.

Я так и не нашел, конкретных ссылок на нормы, которые запрещали бы отправлять людей в дорогу сразу с ночной смены

А в чем здесь Вы видите запрет? Если у Вас вахтовый метод, то непонятно лругое — почему после каждой смены Вас направляют домой?

Обратите внимание на ст. 300-302 ТК РФ, которые регламентируют работ уи отдых «вахтовиков.

Ст. 301 ТК РФ: 

Рабочее время и время отдыха в пределах учетного периода регламентируются графиком работы на вахте, 

В данном графике предусматривается время, необходимое для доставки работников на вахту и обратно.

Дни или часы в пути к месту работы и обратно в рабочее время не включаются и могут приходиться на дни междувахтового отдыха.

Хотелось бы отдельно осветить и включить в объяснительную необхомость или отсуствие таковой касательно межсиенного отдыха перед дорогой… В даанном случае, когда часть смены приходится на день пути, все очевидно, но представим, что смена продолжается до 0.00, а дорога начинается в 0.30 или а 1.00… Это было бы законно?

Дни или часы в пути к месту работы и обратно в рабочее время не включаются и могут приходиться на дни междувахтового отдыха.

Оценивать что-то на предположениях или допущениях в конкретном случае — дело неблагодарное.

Чтобы Вам  (кроме общих фраз) порекомендовать действительно что-то стоящее, надо изучить Ваш распорядок работы, график, трудовой договор. Но это услуга отдельная. А исходя из тех данных что есть, пока можно только сказать, что работодатель усмотрел нарушение трудовой дисциплины и требует объяснений по данному факту. 

А что на самом деле — какой у Вас режим труда и отдыха пока неясно.