Получается, что договор составлен неверно, если ссылается на формы КС-2 и КС-3 и толкуется неправильно?

Здравствуйте! Не бывает договоров субподряда на выполнение услуг. Бывает подряд/субподряд (это выполнение работ) — глава 37 ГК РФ и бывает оказание услуг (глава 39 ГК РФ).

Так что у вас что-то не то сделано.

Нина, здравствуйте!

В случае, в настоящее время составление актов по формам, утвержденных в составе Альбома унифицированных форм первичной учетной документации по учету работ в капитальном строительстве и ремонтно-строительных работ, утв. постановлением Госкомстата РФ от 11.11.1999 N 100, не является обязательным.

С 1 января 2013 года формы первичных учетных документов, содержащиеся в альбомах унифицированных форм первичной учетной документации, не являются обязательными к применению. Вместе с тем обязательными к применению продолжают оставаться формы документов, используемых в качестве первичных учетных документов, установленные уполномоченными органами в соответствии и на основании других федеральных законов (например, кассовые документы) (информация Минфина России N ПЗ-10/2012). 

С другой стороны, стороны вправе установить любые условия, не противоречащие положениям закона.

4. Условия договора определяются по усмотрению сторон, кроме случаев, когда содержание соответствующего условия предписано законом или иными правовыми актами (статья 422). (ст. 421 ГК РФ)

Соответственно, условия договора (в том числе по оформлению результатов оказания услуг по договору), указанные в договоре, обязательны для его сторон (ст. 309, 10 ГК РФ). Однако, в случае неоформления данных актов, указанное обстоятельство не будет являться препятствием для получения оплаты за оказанные услуги (при наличии доказательств фактического оказания услуг).

С уважением, Александр Васильев

Здравствуйте Нина.

Если Вы выполняли именно услуги (а не работы), то факт того, что Вы подпишите акты КС-2 ничего не решают, поскольку в судах обычно главенствует приоритет существа над формой.

Дополнительно обращаю Ваше внимание на следующее.

1. Понятие услуги и работы
Услуга — определенное действие или деятельность, которые исполнитель осуществляет по заданию заказчика (п. 1 ст. 779 ГК РФ). При этом для заказчика ценность представляет процесс исполнения договора, то есть сами действия исполнителя, которые не всегда имеют овеществленный результат.
Обычно оказание услуги и ее потребление происходят одновременно. Например, при оказании консультационных или образовательных услуг исполнитель предоставляет информацию, а заказчик ее сразу же получает.
Работа — деятельность, направленная на достижение определенного овеществленного результата, который может выражаться, например, в создании новой вещи или улучшении имеющейся, в разработке технической документации (по смыслу п. 1 ст. 702, п. 1 ст. 703, ст. 758 ГК РФ). В отличие от договора об оказании услуг в договоре подряда интерес для заказчика представляет не сама деятельность исполнителя, а вещественный результат (Постановление Президиума ВАС РФ от 24.09.2013 N 4593/13 по делу N А41-7649/2012).
2. Различия в регулировании договоров возмездного оказания услуг и подряда
Отношения по оказанию услуг регулируются гл. 39 ГК РФ. Также к ним применяются §1 и §2 гл. 37 ГК РФ, если это не противоречит нормам об оказании услуг и особенностям предмета договора возмездного оказания услуг (ст. 783 ГК РФ). Отношения по выполнению работ регулируются гл. 37 ГК РФ.
Различия проявляются, в частности, в следующем:
•    исполнитель не может привлекать третьих лиц к оказанию услуги, если иное не предусмотрено договором (ст. 780 ГК РФ). Подрядчик же по умолчанию вправе привлечь субподрядчиков (п. 1 ст. 706 ГК РФ);
•    из положений законодательства не следует, что факт оказания услуг обязательно должен оформляться актом приема-передачи. При сдаче результата работ необходимо составлять акт или иной удостоверяющий приемку документ (ст. 720, п. 4 ст. 753 ГК РФ);
•    исполнитель может отказаться от договора при условии возмещения заказчику убытков, устанавливать такое право договором не требуется (п. 2 ст. 782 ГК РФ). Подрядчик немотивированно отказаться от договора по умолчанию не вправе (п. 1 ст. 310 ГК РФ). Правила ГК РФ о подряде предусматривают только право на мотивированный отказ (п. 3 ст. 716, п. 2 ст. 719 ГК РФ).

Но вообще, что бы дать правильную квалификацию отношений необходимо видеть этот договор и проекты актов которые Вам предлагают подписать, так как нередко как исполнители так и заказчики не понимают что они делают (услуги или работы).