Александра, добрый день!
Ничего работодателю Вы не должны возвращать.
Согласно ч. 1 ст. 121 ТК РФ
В стаж работы, дающий право на ежегодный основной оплачиваемый отпуск, включаются:
время, когда работник фактически не работал, но за ним в соответствии с трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права, коллективным договором, соглашениями, локальными нормативными актами, трудовым договором сохранялось место работы (должность), в том числе время ежегодного оплачиваемого отпуска, нерабочие праздничные дни, выходные дни и другие предоставляемые работнику дни отдыха;
Т.е. время отпуска по беременности и родам включается в стаж, необходимый для предоставления основного ежегодного оплачиваемого отпуска. Поэтому время Вашего отпуска по беременности и родам зачитывается в ежегодный отпуск, который Вам уже предоставлен.
Кроме того заработная плата удерживается с работника при увольнении, если до окончания того рабочего года, в счет которого он уже получил ежегодный оплачиваемый отпуск, за неотработанные дни отпуска в соответствии с ч. 2 ст. 137 ТК РФ. Причем удержание не осуществляется, если работник увольняется по основаниям, предусмотренным пунктом 8 части первой статьи 77 или пунктами 1, 2 или 4 части первой статьи 81, пунктах 1, 2, 5, 6 и 7 статьи 83 ТК РФ.
При предоставлении любого вида отпуска удержания из заработной платы за неотработанные дни ежегодного отпуска ТК РФ не предусматривается.
Поэтому Ваш работодатель в данной ситуации не прав.
В случае если будут производиться удержания из Вашей заработной платы, Вам следует обратиться в ГИТ с жалобой на действия работодателя. ГИТ проверит работодателя и при установлении нарушения оштрафует его в соответствии с ч. 1 ст. 5.27 ТК РФ.
При этом данные денежные средства также не возможно будет работодателю взыскать как неосновательное обогащение в силу п. 3 ст. 1109 Гражданского кодекса РФ.