Здравствуйте, Константин!
Насколько следует из Вашего вопроса, Вы являетесь заместителем директора магазина и, по всей видимости, материально ответственным лицом (с Вами, видимо, заключен договор о полной материальной ответственности).
Вместе с тем, само по себе данное обстоятельство не влечет каких-либо особенностей при расторжении трудового договора по инициативе работника (по собственному желанию).
Тут применяются общие правила.
В соответствии со ст. 80 Трудового кодекса РФ:
Работник имеет право расторгнуть трудовой договор, предупредив об этом работодателя в письменной форме не позднее чем за две недели, если иной срок не установлен настоящим Кодексом или иным федеральным законом. Течение указанного срока начинается на следующий день после получения работодателем заявления работника об увольнении.
По соглашению между работником и работодателем трудовой договор может быть расторгнут и до истечения срока предупреждения об увольнении.
То есть трудовой договор с Вами должны были расторгнуть не позднее чем через 2 недели после подачи работодателю заявления об увольнении по собственному желанию.
И, соответственно, в последний день выдать трудовую книжку и произвести полный расчет.
Но важно действительно иметь доказательства подачи заявления об увольнении.
Это может быть либо расписка о получении заявления на втором экземпляре (например, отметка о получении руководителем, секретарем или кадровиком), либо какие-либо иные письменные доказательства.
Это проблемы работодателя. Если у него имеются какие-либо претензии к работнику, то он должен провести проверку в течение 2 недель до момента увольнения. Но задерживать срок увольнения в связи с этим у работодателя полномочий по закону нет.
В настоящее время Вы можете просто не выходить на работу и требовать с работодателя выплаты расчета и выдачи трудовой книжки. При этом рекомендую обратиться с письменной жалобой на отказ работодателя выдать трудовую книжку и расчет не только в инспекцию труда, но и в прокуратуру. Как показывает практика, реакция прокуратуры зачастую бывает быстрее, чем у инспекции труда.