Здравствуйте, согласно статье 29 Положения о порядке прохождения военной службы
18. Военнослужащим, заболевшим во время основного или дополнительного отпуска, кроме отпуска по личным обстоятельствам, основной или дополнительный отпуск продлевается на соответствующее количество дней болезни. Продление отпуска в этом случае осуществляется командиром воинской части на основании справки из лечебного учреждения.
Не сказано что лечебное учреждение должно быть военным.
Обращение в суд за защитой нарушенного права осуществляется в течение 3-х месяцев с момента нарушения прав.