Добрый день, Вадим!
Коллега верно указала главный ориентир, по п. 99 Приказа Министра обороны РФ № 727 от 06.12.2019 оклад по должности, оклад по воинскому званию и надбавка за выслугу лет за период непрерывного нахождения на лечении сохраняются в полном объёме, а вот именно «боевые» надбавки (ежемесячная социальная выплата, суточные, два оклада за участие в СВО) начисляются только за фактическое выполнение задач и с уходом в отпуск и на лечение действительно могут быть приостановлены, это не нарушение. Раз вы регулярно предоставляете справки командованию, это правильная линия поведения, обязательно сохраняйте копии с отметкой о приёме, поскольку именно эти справки подтверждают непрерывность лечения для целей п. 99.
Отдельно стоит поднять вопрос о возмещении расходов на само лечение. Раз вы лечитесь в гражданском учреждении за свой счёт, у вас есть основания требовать компенсацию, но только при условии, что обращение в частную или гражданскую медицинскую организацию было согласовано с медицинской службой части или обусловлено объективной невозможностью получить помощь в военном лечебном учреждении вовремя. Рекомендую прямо сейчас, не откладывая, подать рапорт с обоснованием, почему лечение проходит вне военно-медицинских организаций, и приложить чеки и медицинские документы, это создаст основание для ретроактивного возмещения расходов через часть либо по линии ОМС.
И ещё один момент, который часто упускают из виду, сосредоточившись только на текущей зарплате. Если ваше заболевание связано с годом непрерывного пребывания в зоне СВО, имеет смысл инициировать военно-врачебную экспертизу для получения заключения о причинной связи заболевания с исполнением обязанностей военной службы (Положение о военно-врачебной экспертизе, утв. Постановлением Правительства № 565). Именно это заключение, а не сам факт лечения, служит основанием для отдельных, куда более существенных выплат, единовременного пособия по ст. 3 ФЗ № 306-ФЗ и страхового возмещения по ФЗ № 52-ФЗ, если заболевание признают военной травмой или связанным с исполнением служебных обязанностей.
Если по вашей ситуации останутся вопросы, буду рад помочь, обращайтесь ко мне напрямую.
Обращаю внимание, что ответ подготовлен исходя из тех деталей, которые указаны в вопросе, и при уточнении обстоятельств дела оценка ситуации может измениться.
С уважением, Руслан
За ответ можно отблагодарить положительной отметкой или здесь: pravoved.ru/pay/lawyer-reward/id/4379475/