Анна, здравствуйте.
Разделить форматы можно, но не так просто, как хотелось бы. По ст. 16 273-ФЗ дистанционные технологии применять разрешено, и при полностью дистанционной реализации программы местом осуществления деятельности признаётся адрес самой организации (место нахождения по уставу/ЕГРЮЛ), а не адрес, где физически сидят ученики. То есть теоретически схема "основное - дистант по юр.адресу, допобразование - очно по другому адресу" рабочая.
Но есть нюансы, из-за которых всё может развалиться:
Первый - у вас сейчас адрес фактического ведения деятельности не совпадает с уставным. Это само по себе нарушение лицензионных требований по ст. 91 273-ФЗ - в приложении к лицензии должны быть указаны реальные адреса мест осуществления деятельности, и они должны совпадать с тем, что заявлено в учредительных документах и в ЕГРЮЛ. Пока это не устранено, вносить новые изменения в лицензию рискованно - проверка выявит расхождение сразу.
Второй - не любую общеобразовательную программу можно перевести на 100% дистант. По ФГОС ряд предметов и элементов программы (практика, лабораторные, физкультура, ОБЗР и т.п.) требуют очного компонента, плюс для отдельных ступеней и категорий обучающихся действуют ограничения. Формально "уйти на дистант" по всей общеобразовательной программе не всегда допустимо - это нужно проверять по конкретным программам, которые вы реализуете.
Третий - помещение для допобразования всё равно должно отвечать требованиям СанПиН именно для этого вида деятельности (по площади, отделке, освещению, этажности для детей до 11 лет и т.д.), и это должно быть подтверждено санитарно-эпидемиологическим заключением при подаче на лицензию.