На сколько это правомерно и как правильно поступить в данной ситуации?

Ситуация вполне законная, но требует правильного документального оформления, чтобы у ООО не возникло проблем с налоговой (ФНС) по поводу обоснованности расходов и статуса налогового агента.
 
1. Правомерность
Согласно ст. 185 ГК РФ, собственник вправе делегировать полномочия по управлению имуществом и получению денег любому лицу через нотариальную доверенность. Поскольку в доверенности прямо прописаны фразы «с правом сдачи в аренду» и «с правом получения денег», супруга выступает как законный представитель.
 
2. Как правильно поступить
Вам не нужен новый договор, так как собственник помещения не изменился. Достаточно оформить дополнительное соглашение к действующему договору аренды.
В доп. соглашении укажите:
Что в связи с наличием нотариальной доверенности (укажите номер, дату и данные нотариуса) оплата аренды с определенной даты производится по реквизитам супруги (укажите её полные банковские реквизиты).
Приложите заверенную копию доверенности к вашему экземпляру договора.
 
3. Критически важный нюанс: Налоги (НДФЛ)
Несмотря на то, что деньги уходят на счет супруги, доход по-прежнему считается доходом собственника-мужа (физического лица).
Вы — налоговый агент: ООО обязано удерживать 13% НДФЛ из суммы арендной платы и перечислять их в бюджет (ст. 226 НК РФ).
Важно: В платежном поручении на выплату аренды супруге обязательно указывайте в назначении платежа: «Арендная плата за [месяц] по договору №… за [ФИО мужа-собственника] на основании доверенности...».
Отчетность: В справках 2-НДФЛ и расчетах 6-НДФЛ получателем дохода должен фигурировать муж (собственник), так как именно он получает экономическую выгоду от сдачи своего имущества.
Риск: Если вы начнете платить супруге без доп. соглашения и упоминания мужа в назначении платежа, налоговая может признать это «иным доходом» супруги и потребовать уплаты НДФЛ еще раз или отказать ООО в принятии этих сумм в расходы.