Здравствуйте.
Для начала следует отметить, что под дропшиппингом обычно понимается оказание посреднических услуг покупателям за какой-то фиксированный или плавающий процент, при этом все физические операции ведутся непосредственно между покупателем и продавцом, а финансовые – через такого посредника. Поскольку по сути как я понял из вопроса, Вы и являетесь таким посредником, главное условие для налогообложения именно и только Вашего вознаграждения, это правильно оформление Ваших отношений с контрагентами. Ведь если Вы заключаете договор купли-продажи с продавцом и сходный договор с покупателем, получается, что право собственности на товар на какое-то время переходит к Вам, что приводит к тому, что по документам получается, что Вы конечному покупателю продаете свой товар. Это, во-первых, не соответствует действительности, во-вторых, накладывает на Вас дополнительные обязательства перед покупателем, и, в-третьих, заставляет Вас всю сумму, полученную от покупателя включать в налогооблагаемую базу.
Избежать такой ситуации Вы можете при задействовании механизма, установленный ст. 1005 ГК РФ – агентский договор. Но при этом Вам придется решить, с кем именно Вы заключите такой договор. Если Вы будете заключать договор с поставщиком (поставщиками), то получается, что Вы являетесь именно его (их) агентом, заключаете договора купли-продажи покупателями продукции от его (их) имени и получаете вознаграждение от него (них) в виде фиксированного процента, который устанавливается договором. Учитывая, что поставщиков может быть много и не всякий согласится на заключение договора с Вами как с агентом, логичнее заключать агентские договора с покупателями.
Указанные договора могут заключаться в форме согласия договором-офертой, размещенном на Вашем сайте, и соответственно, Принципалом, для Вас как Агента будет именно покупатель. Он и будет лицом, выплачивающим Вам вознаграждение.
Что касается сертификатов, то они Вам не нужны, поскольку Вы не являетесь продавцом, но лишь посредником между продавцом и покупателем. Если же покупателем будете Вы и будете перепродавать товар, то естественно все обязанности, предусмотренные таможенным законодательством, налоговым и т.д. будут возложены на Вас. Это касается и сертифицирования/декларирования товаров, их маркировки.
Если Вам потребуется дополнительная консультация по этому вопросу и/или составление документов, либо возникнут иные правовые вопросы, Вы можете обратиться ко мне в чат за персональной консультацией.
Для самого магазина, который фактически таковым не является если работать по схеме дропшиппинга (т.к. не является собственником прдавемого товара), никакие сертификаты не нужны.