Здравствуйте!
В данном случае речь идет не о «регистрации», а о миграционном учете по месту пребывания
Граждане РБ могут находиться в РФ без оформления миграционного учета 90 суток, согласно ст. 3 «Соглашения между Российской Федерацией и Республикой Беларусь об обеспечении равных прав граждан Российской Федерации и Республики Беларусь на свободу передвижения, выбор места пребывания и жительства на территориях государств — участников Союзного государства»
Срок у вас не нарушен
Что делать?
Рекомендую матери ( собственнице) лично обратиться в отдел по вопросам миграции ОМВД для уточнения причин отказа и подать уведомление о прибытии установоленной формы