Здравствуйте!
В дополнение к ответу своего коллеги, хотелось бы сказать пару слов о том, что процедуру реорганизации можно попытаться оспорить — обратиться с заявлением о признании незаконными действий налоговой по внесению в Единый государственный реестр юридических лиц записей о начале процесса реорганизации и о его завершении. Но это может иметь положительный результат только в том случае, если ООО не представило в налоговую документов, подтверждающих уведомление всех кредиторов о реорганизации (а такие документы должны быть представлены), или были допущены иные процедурные ошибки.
Если реорганизация еще не завершена, я бы рекомендовала вам связаться с налоговой и изложить им ситуацию (лучше всего — письменно).