Валентина, здравствуйте!
Стороны договора, при заключении трудового договора, заключают его в соответствии с понятиями, которые установлены в ст. 56-57 ТК РФ.
соглашение между работодателем и работником, в соответствии с которым работодатель обязуется предоставить работнику работу по обусловленной трудовой функции, обеспечить условия труда, предусмотренные трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права
https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_34683/1eaf2e1beb877bbca22338c719320a5b9c692297/
Согласно ст. 57 ТК РФ, по соглашению сторон в трудовой договор могут также включаться права и обязанности работника и работодателя. Кроме того, в трудовом договоре могут предусматриваться дополнительные условия, не ухудшающие положение работника по сравнению с установленным трудовым законодательством.
Обязательными для включения в трудовой договор являются следующие условия:
другие условия в случаях, предусмотренных трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права.
https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_34683/1eaf2e1beb877bbca22338c719320a5b9c692297/
В связи с чем, вы вправе прописать условия из вашего вопроса в трудовой договор с работником.
1. Оплачиваем ему суточные 1000 руб. в день
Укажите, что " работнику в случае командировки, будут выплачиваться суточные за каждый день нахождения в командировке, в том числе за выходные и праздничные дни в размере 1000 рублей в сутки"
2. Помимо основного ежегодного проезда до места отдыха (в оплачиваемый отпуск) ему будут оплачиваться два проезда до г. Н… и обратно (необходимо сотруднику два раза в год на медицинское обследование вылетать).
«Для целей прохождения медицинского обследования работника, не чаще два раза в год, ему оплачивается проезд до места проведения медицинского обследования и обратно, с последующем предоставлением авансового отчета о поездке»
3. Оплачиваем ему квартиру в городе где находится наша организация.
«На период трудовых отношений, работнику компенсируется (оплачивается) найм жилого помещения в городе… Работник должен предоставить работодателю договор найма жилого помещения ( в случае договора с ним о найме им жилого помещения), а не работодателем) и платежные документы, подтверждающие оплату найма жилого помещения.»
Ниже я дополню свой ответ вам.
С уважением.
Я дополняю вам свой ответ:
Если работодатель от себя будет заключать договор найма для работника, а не компенсировать договор работника с наймодателем, то можно прописать первое предложение так:
«На период трудовых отношений, работнику предоставляется жилое помещения в городе…".
С уважением.
Если у вас остались ко мне уточнения вашего вопроса или моего ответа, то можете мне их задать в чат личных сообщений. С уважением.