Как правильно поступить в данной ситуации - писать им ходатайство или другой документ?

Илья, добрый день! Возможно претензии налоговой связаны со статусом помещения (нежилое) и его использованием. В частности согласно п. 17.1 ст. 217 НК РФ

Положения настоящего пунктане распространяются на доходы, получаемые… физическими лицами от продажи имущества (за исключением жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, садовых домов или доли (долей) в них, а также транспортных средств), непосредственно используемого в предпринимательской деятельности;

соот. вопрос — что это за помещение? Не сдавалось ли в аренду либо не использовалось ли иным образом для осуществления предпринимательской деятельности. Ссылка не открывается, если есть возможность прикрепите документы непосредственно в данном вопросе

Здравствуйте, Илья.

Не столь важно, как вы назовете документ, направляемый Вами на акт налоговой проверки, важно его содержание.

Непосредственно в п.6 ст.100 НК РФ несогласие налогоплательщика с содержанием акта налоговой проверки, выводами проверяющего названо письменными возражениями. Основывать их следует на положениях ст.8.1 ГК РФ,  ст.33,34 СК РФ, п.17.1 ст.217 НК РФ об освобождении от налогооблажения доходов от продажи объектов, срок владения которыми превысил минимальный, п.4 ст.229 НК РФ об отсутствии обязанностей декларировать доходы, освобождаемые от налогооблажения,  и разъяснениях Минфина в Письмах  № 03-04-05/88173 от 15.11.2019,  № 03-04-05/106746  от 28 декабря 2021 г.,  № 03-04-05/6916  от  6.02. 2018 г.смысл которых сводится к тому, что заключение брачного договора, в результате которого прекратился режим совместной собственности, или право на объект перешло полностью к одному из супругов, на срок владения не влияет, он исчисляется с даты приобретения объекта в общую совместную собственность. Более в возражениях ничего писать не требуется. В акте отсутствуют доводы о том, что положения п.17.1 ст.217 НК РФ не применяются к объектам, используемым в предпринимательстве, то есть данные обстоятельства предметом проверки и не являлись и не устанавливались. Во время рассмотрения материалов проверки нужно быть готовым ответить на возможные вопросы по данному поводу, если они возникнут у рассматривающих (если Вы намерены присутствовать во время рассмотрения).

Илья, здравствуйте! 

Ваша ситуация намного хуже, чем вы думаете.

Каждому супругу прислали аналогичное требование по уплате налога раз у вас долевая собственность? 

На данный момент налоговая просто посчитала вам налог с учетом того, что вы продали нежилое помещение которое якобы  НЕ использовалось в предпринимательской деятельности ранее минимального (на взгляд инспектора) срока владения и не подали декларацию и не уплатили налог. Они даже вам вычет учли по нежилому фонду 125 тыс.(250 тыс. /2).

Если налоговая начнет «копать» и выяснит сдачу в аренду -а это несложно сделать раз вы сдавали помещение официально юрлицу, то наступят совсем иные последствия.

Вам как физлицу доначислят НДС за все годы, пени  по ставке рефинансирования ЦБ РФ, вычет по 125 тыс. аннулируют. Вашу деятельность переквалифицрует в предпринимательскую со всеми последствиями.

www.nalog.gov.ru/rn77/taxation/jud_settlement/7860029/

Претензии налоговой пока не связаны со ст.217 пункт 17.1 НК РФ.

В ваших интересах не спорить сейчас с налоговой, оплатить все в надежде, что про НДС и прочее инспектор не узнает. Иначе все выйдет гораздо дороже для вас к сожалению.

Надо было открывать ИП, выбирать систему налогобложения УСН (доход, либо доход минус расход).

ИП на УСН при сдаче в аренду нежилого помещения освобожден от уплаты НДС.

И продавать тоже в статусе ИП, платить налог согласно ставке налогобложения.

С уважением, Алсу Нафисовна.