Здравствуйте.
Обычно соглашение о выделе долей детям в квартире, приобретенной за счет материнского капитала не требует нотариального удостоверения. Однако поскольку помимо этого вы намереваетесь еще и определить доли между супругами — придется посетить и нотариуса тоже. В принципе это можно сделать за одно посещение в ходе которого нотариус удостоверит ваше соглашение о разделе имущества между супругами и в том же соглашении определите распределение долей между супругой и двумя детьми.
Второй вариант подписать и удостоверить нотариально соглашение о разделе квартиры, где 100% получает супруга (квартира становится ее единоличной собственностью по ст. 36 К РФ), а выделение долей ею детям произвести уже в простой письменной форме. На регистрацию перехода права собственности в МФЦ можно подать оба документа сразу.
Согласно позиции Минфина России по данному вопросу, за нотариальное удостоверение соглашения о разделе общего имущества, нажитого супругами в период брака, государственная пошлина (нотариальный тариф) должна уплачиваться в размере 500 рублей по п/п 6 п. 1 ст. 333.24 Налогового кодекса РФ как за удостоверение сделок, предмет которых не подлежит оценке. Дополнительно нотариус берет плату за техническое оформление.
Регистрация в Росреестре потребует госпошлину в размере 2000 рублей за каждое регистрационное действие.
Если Вам необходима подготовка документов — за их составлением можете обратиться ко мне в чат.
Касаемо госпошлины, но у нотариуса 6500 + 0,3% от кадастровой стоимости, за регистрацию права еще, примерно 2000 рублей, так как точнее нужно считать, у Вас сложная регистрация будет, но в районе 2000.