Если коротко. Доля это понятие идеальное. Выдел же доли в натуре возможен если объект вообще делим. В МКД (квартиры) выдел доли в натуре вообще не возможен в силу прямого запрета.
При этом есть правило. Жилье, приобретаемое с использованием средств материнского капитала, должно быть оформлено в общую собственность родителей и детей (в том числе первого, второго, третьего ребенка и последующих детей) с определением размера долей по соглашению (ч. 4 ст. 10 Закона N 256-ФЗ).
Таким образом, Вы, наверное, хотите путем гражданско-правовых сделок с идеальными долями всех участников долевой собственности в двух объектах.
Законным представителем детей являетесь по сделкам вы.
Доли свои и матери в квартире Вы можете и подарить детям. Представителем н\с детей будете выступать Вы. А вот долю ребенка в квартире он может отчуждать с согласия органов опеки.
В доме также отчуждение долей н\с детей требует согласия органов опеки и банка, так как меняется субъектный состав залогодателей по договору кредита.