Вопрос: в данном случае, можно ли требовать пересчет ущерба по ценам их закупки у правообладателя, ведь уже в цену закупки входят авторские отчисления?

Здравствуйте, Виктория! Ущерб считает прежде всего следователь, который проводит предварительное расследование. Потерпевший лишь предоставил необходимые сведения о стоимости причиненного ущерба.

Согласно п.25 Постановления Пленума Верховного Суда РФ от 26.04.2007 N 14 «О практике рассмотрения судами уголовных дел о нарушении авторских, смежных, изобретательских и патентных прав, а также о незаконном использовании товарного знака»

Устанавливая признаки крупного или особо крупного размера деяний, предусмотренных частями 2 и 3 статьи 146 УК РФ, следует исходить из розничной стоимости оригинальных (лицензионных) экземпляров произведений или фонограмм на момент совершения преступления, исходя при этом из их количества, включая копии произведений или фонограмм, принадлежащих различным правообладателям.

То есть, ущерб оценивается по розничным ценам, следователь прав.

Если же розничная стоимость завышена, то Вы вправе заявить ходатайство о проведении товароведческой (оценочной) экспертизы.

Здравствуйте, Виктория! Как следует из примечания к ст.146 УК РФ, деяния, предусмотренные настоящей статьей, признаются совершенными в крупном размере, если стоимость экземпляров произведений или фонограмм либо стоимость прав на использование объектов авторского права и смежных прав превышают сто тысяч рублей, а в особо крупном размере — один миллион рублей.

Как следует из разъяснений п.25 Постановления Пленума Верховного Суда РФ от 26.04.2007 N 14 «О практике рассмотрения судами уголовных дел о нарушении авторских, смежных, изобретательских и патентных прав, а также о незаконном использовании товарного знака» устанавливая признаки крупного или особо крупного размера деяний, предусмотренных частями 2 и 3 статьи 146 УК РФ, следует исходить из розничной стоимости оригинальных (лицензионных) экземпляров произведений или фонограмм на момент совершения преступления, исходя при этом из их количества, включая копии произведений или фонограмм, принадлежащих различным правообладателям. При этом в соответствии с данным пунктом Постановления:

При необходимости стоимость контрафактных экземпляров произведений или фонограмм, а также стоимость прав на использование объектов интеллектуальной собственности может быть установлена путем проведения экспертизы (например, в случаях, когда их стоимость еще не определена правообладателем).

Поэтому, к сожалению, в вашем случае учитывается именно розничная стоимость контрафактных учебников, а не цены, по которым они поставляются (ст.506 ГК РФ):

По договору поставки поставщик-продавец, осуществляющий предпринимательскую деятельность, обязуется передать в обусловленный срок или сроки производимые или закупаемые им товары покупателю для использования в предпринимательской деятельности или в иных целях, не связанных с личным, семейным, домашним и иным подобным использованием.

А в соответствии с п.1 ст.492 ГК РФ по договору розничной купли-продажи продавец, осуществляющий предпринимательскую деятельность по продаже товаров в розницу, обязуется передать покупателю товар, предназначенный для личного, семейного, домашнего или иного использования, не связанного с предпринимательской деятельностью.

Если у Вас есть сомнения по поводу представленных правообладателем (представителем) доказательств той или иной розничной стоимости 

оригинальных (лицензионных) экземпляров произведений, следует ходатайствовать о проведении оценочной экспертизы. Перед этим Вы вправе собрать собственные доказательства, свидетельствующие о том, что рыночная стоимость лицензионных экземпляров на самом деле ниже, поскольку правообладатель может быть заинтересован в завышении цены в целях взыскания с Вас большей компенсации за нарушение авторских прав (ст.1301 ГК РФ):

ГК РФ Статья 1301. Ответственность за нарушение исключительного права на произведение 

В случаях нарушения исключительного права на произведение автор или иной правообладатель наряду с использованием других применимых способов защиты и мер ответственности, установленных настоящим Кодексом (статьи 1250, 1252 и 1253), вправе в соответствии с пунктом 3 статьи 1252 настоящего Кодекса требовать по своему выбору от нарушителя вместо возмещения убытков выплаты компенсации:
1) в размере от десяти тысяч рублей до пяти миллионов рублей, определяемом по усмотрению суда исходя из характера нарушения;

2) в двукратном размере стоимости контрафактных экземпляров произведения;
3) в двукратном размере стоимости права использования произведения, определяемой исходя из цены, которая при сравнимых обстоятельствах обычно взимается за правомерное использование произведения тем способом, который использовал нарушитель.

Правообладатель, если он не заявил гражданский иск в рамках уголовного дела, может сделать это отдельно в рамках гражданского судопроизводства. Если адвоката у Вас еще нет, настоятельно рекомендую нанять его (государственный, бесплатный адвокат Вам особой пользы не принесет), поскольку по делам в части нарушения авторских прав много нюансов, как минимум адвокат (грамотный профессионал в авторском праве) поможет снизить размер наказания. В определенных случаях вообще под вопросом сам состав преступления по ч.2 и 3 ст.146 УК РФ.