Дмитрий, добрый день!
Сразу объясню, что общий трудовой стаж — это суммарная продолжительность трудовой и иной общественно-полезной деятельности до 1 января 2002 года. Он учитывается при проведении оценки пенсионных прав граждан, имеющих периоды работы до 2002 года.
А вот страховой стаж — это периоды работы гражданина, в течение которых за него начислялись и уплачивались страховые взносы в Пенсионный фонд. Кроме того, в него входят и так называемые «нестраховые» периоды: отпуск по уходу за ребенком до 1,5 лет, получение пособия по безработице, уход неработающего трудоспособного гражданина за инвалидом I группы, ребенком-инвалидом и лицом старше 80 лет, период участия в оплачиваемых общественных работах и др. Сейчас термин «страховой стаж» применяется при определении права на пенсию.
Если Вы были оформлены надлежащим образом, делались отчисления в ПФР И ФСС, то увольнение по п.1 ст.83 ТК РФ не является основанием для того, чтобы не учитывать отработанные Вами время в страховой стаж. Кроме того, согласно п. 1 ч. 1 ст. 12 ФЗ N 400-ФЗ «О страховых пенсиях» в страховой стаж наравне с периодами работы и (или) иной деятельности засчитывается период прохождения военной службы.
Поэтому, трудовой период до армии, служба в армии и дальнейшее трудоустройство должны учитываться при исчислении стажа.
Дмитрий, возможно данные доплаты были предусмотрены локальными нормативными актами самой организации, при например, непрерывной работе. Но, ст. 20 ФЗ N 166-ФЗ говорит, что в случае, если для назначения соответствующей пенсии, предусмотренной требуется трудовой стаж определенной продолжительности, в него включаются периоды работы и другой общественно полезной деятельности, засчитываемые в страховой стаж, необходимый для получения трудовой пенсии, предусмотренной Федеральным законом «О страховых пенсиях». Поэтому Вашу трудовую деятельность, что в трудовой, что в страховой стаж включить должны.