Здравствуйте, Екатерина!
В соответствии с частью третьей ст. 79 ТК РФ трудовой договор, заключенный на время исполнения обязанностей отсутствующего работника, прекращается с выходом этого работника на работу. Если работник увольняется, не выходя из отпуска, возникает весьма затруднительная ситуация. Оснований для расторжения трудового договора в данном случае нет. Уволить временного работника по пункту 2 части 1 ст. 77 ТК РФ нельзя, поскольку событие, с которым закон связывает истечение срока трудового договора — выход на работу основного работника — так и не наступило (и не наступит никогда).
Трудовой договор утрачивает статус срочного и становится договором, заключенным на неопределенный срок. Уволить такого работника можно только в общеустановленном порядке согласно Трудовому кодексу РФ.
Ответ: увольнение по ст. 79 ТК РФ в данном случае неправомерно. Однако, на мой взгляд, ссылка на эту статью будет законной, если основной работник сначала восстановилась, а затем только написала заявление на увольнение. Уточните эту деталь в отделе кадров.
С уважением, Юлия Владимировна.