Здравствуйте, Вадим.
Обращение с жалобой в ГИТ и (или) прокуратуру не решит вопроса с выплатой тех сумм, которые, как вы считаете, работодатель вам недоплатил. Если хотите, чтобы работодателю потрепали нервы проверкой, то сгодится и жалоба, но взыскивать зарплату можно только через суд.
как правильно аргументировать нарушения закона
Вадим
в иске вы не обязаны ссылаться на конкретные нормы закона, суд обязан сам применить нормы, подлежащие применению. Но для большей гарантии выигрыша (который отнюдь не гарантирован) советую за составлением иска обратиться с документами, которые у вас есть к юристу.