Здравствуйте,
Трудовой договор, заключенный на время исполнения обязанностей отсутствующего работника, прекращается с выходом этого работника на работу (статья 79 ТК РФ).
Вместе с тем, увольнение женщины в период ее беременности в указанном случае допускается, если невозможно с письменного согласия женщины перевести ее до окончания беременности на другую имеющуюся у работодателя работу (статья 261 ТК РФ).
(При этом имеется в виду как вакантная должность или работа, соответствующая квалификации женщины, так и вакантная нижестоящая должность или нижеоплачиваемая работа, которую женщина может выполнять с учетом ее состояния здоровья.)
Учитывая изложенное, в случае вашего перевода до выхода на работу работника, в связи с исполнением обязанностей которого заключен срочный трудовой договор, на другую имеющуюся у работодателя работу, вы имеет право на отпуск по беременности и родам с выплатой пособия по государственному социальному страхованию в установленном федеральными законами размере.
Дополнение: право на отпуск по беременности и родам после получения в установленном порядке листка нетрудоспособности.