Виктор,
Ситуация непростая, придётся доказывать в суде фактически сложившиеся между вами и работодателем трудовые отношения (отсутствие договора не препятствие).
Что я могу вам посоветовать:
1. Возможно у вас остались какие-то документы подтверждающие фактические трудовые отношения c работодателем, доверенность, письменные поручения и.т.д. (предъявите их в суд). В любом случае командировочные также не выплачиваются просто так, а связаны с трудоустройством (суд этот факт оценит).
Запросите через суд: в банке назначение платежей от работодателя, которые перечислялись вам на карту и у организации документы о перечислении вам денег.
Суд будет оценивать все обстоятельства и документы в совокупности.
2.Возьмите двух свидетелей работавших там ранее с вами или работающих в настоящее время, приведите их в суд, чтобы они подтвердили наличие фактических трудовых отношений с Вами.
Удачи!