Отказ продлить отпуск на время стационара и ВВК — неправомерен. Вы подали рапорт на ВВК, вас направили на обследование, и командование обязано обеспечить вам возможность его пройти. Отказ в продлении отпуска на эти сутки — это нарушение вашего права на медицинское освидетельствование.
Попытка исключить из списков части до завершения ВВК — тоже неправомерна. По п. 11 ст. 38 ФЗ № 53-ФЗ военнослужащий не может быть исключён из списков, пока находится на лечении или проходит ВВК. Пока заключение не утверждено в Москве — ВВК юридически не завершено, и оснований для исключения нет.
А вот перенос даты исключения на момент завершения ВВК плюс 2 суток на сдачу дел — это правомерно. Это соответствует ст. 34 Положения о порядке прохождения военной службы: сначала — утверждённое заключение ВВК, потом сдача дел, потом исключение. До полного расчёта и обеспечения вас не имеют права исключить без вашего согласия.
Командировочный для поездки на диагностику в другой город — оформлен верно. Направление на ВВК — это служебное поручение, так что командировка здесь корректна.
Что я рекомендую сделать прямо сейчас:
Соберите все документы: рапорта с отметками о вручении, справки из медучреждения о нахождении на лечении, ответы об отказе в продлении отпуска. Всё это пригодится, если придётся обжаловать.
Следите, чтобы дата исключения не сдвинулась раньше утверждения ВВК. Если попытаются — обжалуйте приказ в военный суд в порядке КАС РФ (на это есть 3 месяца) или через военную прокуратуру.
Проверьте, что к моменту исключения вы полностью обеспечены всем положенным — денежным довольствием, вещевым имуществом, расчётом. Без этого исключение незаконно.
Если коротко: финальное решение командования — перенести дату исключения на завершение ВВК — правильное. Но отказ в продлении отпуска и попытка исключить вас до утверждения заключения — это нарушения, их можно обжаловать, если есть желание.