Наталия, оформление инвалидности само по себе не означает ни обязанность немедленно выйти на работу, ни увольнение. Инвалидность, временная нетрудоспособность и медицинские противопоказания к конкретной работе — разные вопросы.
При установлении группы действующий больничный оформляется с учётом специального правила пункта 36 Порядка, утверждённого приказом Минздрава № 1089н: соответствующий период завершается датой, предшествующей регистрации документов в бюро МСЭ. Дальнейшее освобождение от работы зависит от сохраняющейся временной нетрудоспособности и решения медицинской организации. Для пособия после признания инвалидом действует ограничение части 3 статьи 6 Закона № 255-ФЗ — обычно не более четырёх месяцев подряд или пяти месяцев в календарном году; для туберкулёза предусмотрено исключение. Это ограничение оплаты, а не самостоятельное основание увольнения.
Попросите лечащего врача и врачебную комиссию письменно определить порядок оформления больничного на период оставшейся химиотерапии и разъяснить даты его закрытия и последующего открытия при наличии оснований. Вопрос о допустимой работе решается по медицинским ограничениям, а не только по номеру группы. Подавать заявление об увольнении лишь из-за направления на МСЭ не требуется.