Добрый день. Само по себе наличие отдельного кадастрового номера у здания в целом не означает, что квартиры объединяются в один объект или переходят в общую собственность. Если в ЕГРН Ваши объекты зарегистрированы именно как две квартиры, они юридически являются помещениями внутри здания, поэтому у самого здания также может быть отдельный кадастровый номер, а у каждой квартиры — свой. Многоквартирным домом признается здание, состоящее из двух и более квартир и имеющее общее конструктивное имущество, что следует из части 6 статьи 15 и статьи 36 ЖК РФ.
Однако по описанным признакам — отдельные входы, самостоятельные земельные участки и фактически разделенные конструкции — объект может соответствовать не многоквартирному дому, а двум домам блокированной застройки. Согласно пункту 40 статьи 1 ГрК РФ дом блокированной застройки является самостоятельным жилым домом, соединенным с соседним домом общей боковой стеной без проемов и имеющим отдельный выход на земельный участок. В таком случае каждый блок должен учитываться как отдельное здание со своим кадастровым номером, а не как квартира в составе единого многоквартирного дома.
Поэтому важно уточнить, что именно требует архитектура. Если речь идет только о постановке существующего здания на кадастровый учет с сохранением Ваших отдельных квартир, это может быть правомерно. Если же от Вас требуют объединить квартиры в один жилой дом, прекратить их отдельный кадастровый учет либо оформить общее право собственности, такое требование нельзя считать законным без технического обследования, подготовки технического плана, волеизъявления собственников или соответствующего судебного решения. Кадастровый номер присваивает Росреестр при государственном кадастровом учете по Федеральному закону № 218-ФЗ, а не управление архитектуры самостоятельно.
Потребуйте от управления архитектуры письменное требование с указанием нормы закона и цели постановки дома на учет. После этого нужно получить выписки ЕГРН на обе квартиры и оба земельных участка, технические паспорта и проверить, как фактически описан объект. Если имеются признаки блокированной застройки, целесообразно оформлять каждый объект как отдельный жилой дом, а незаконный отказ или требование администрации можно обжаловать в суде. Могу изучить выписки и письменный ответ архитектуры и определить, какой вариант оформления соответствует фактическому устройству дома.