Дополню по правовой стороне — здесь есть нюанс, от которого зависит, как строить жалобу и иск.
Прямой запрет отчисления во время болезни (ч. 6 ст. 43 ФЗ «Об образовании») касается отчисления как меры дисциплинарного взыскания. За академическую задолженность вуз отчисляет по другому основанию — п. 2 ч. 2 ст. 61 и ч. 11 ст. 58 того же закона, и формально под этот запрет такое отчисление не подпадает. Беременность сама по себе от отчисления за неуспеваемость тоже не защищает. Поэтому строить жалобу только на больничном и беременности рискованно: вуз ответит, что отчислил не «за проступок», а за неликвидированную задолженность, — и спор уйдёт в другую плоскость.
Бить нужно по процедуре ст. 58 — и здесь позиция у вас сильная:
Вуз обязан предоставить две попытки пересдачи (вторую — комиссии) и сам назначить их сроки, причём время болезни в эти сроки не включается. Если пересдачи выпали на период больничного или их вообще не назначали — отчисление преждевременно: суды признают его незаконным, когда вуз не создал условий для ликвидации задолженности и не довёл до студента график пересдач.
Задолженность тянется с 3 курса, а вас при этом переводили на следующие курсы. Запросите в деканате письменно: график пересдач, доказательства его доведения до вас, локальный акт о порядке ликвидации задолженности, копию приказа об отчислении с основанием. Эти документы покажут, соблюдал ли вуз собственную процедуру, — на них будет строиться и жалоба, и иск.
Помимо прокуратуры используйте комиссию по урегулированию споров между участниками образовательных отношений (ст. 45 ФЗ «Об образовании») — внутривузовский механизм, бесплатный и быстрый. Профильный надзорный орган по таким нарушениям — Рособрнадзор.
Академический отпуск по беременности или медицинским показаниям (приказ Минобрнауки от 13.06.2013 № 455) оформляется только по заявлению студента — «автоматически» вуз его не предоставит, а отчисленному он уже недоступен. Поэтому порядок такой: сначала добиваться отмены приказа, и сразу после отмены подать письменное заявление на отпуск под отметку о приёме.
По ожиданиям: автоматической отмены приказа не будет — исход зависит от того, как назначались пересдачи и уведомляли ли вас о них. Но связка «больничный + нарушение процедуры пересдач» в судебной практике работает.
Готов уточнить детали по вашей ситуации, если есть дополнительные вопросы.