Здравствуйте. Квартира принадлежит вам как единственному собственнику, и именно вы вправе владеть, пользоваться и распоряжаться ею по ст. 209 ГК РФ. Сам факт регистрации дочери в квартире и возможная оплата ею ипотеки не делают её собственником и не создают у неё долю автоматически. Право собственности на недвижимость возникает на основании сделки/наследства/судебного акта и государственной регистрации в ЕГРН, а не из факта оплаты чужого кредита.
Если дочь погасит часть или весь остаток ипотеки своими деньгами, она сможет в будущем требовать только возврата уплаченной суммы, если докажет, что платила именно за вас и без намерения подарить деньги. Это может квалифицироваться как исполнение обязательства третьим лицом по ст. 313 ГК РФ либо как денежное требование, но не как основание для получения доли в квартире. Долю она получит только если вы сами оформите дарение, продажу, соглашение или иной переход права с регистрацией в Росреестре.
Продажу квартиры факт оплаты ипотеки дочерью напрямую не блокирует. Но пока квартира в залоге у банка, отчуждение возможно с учётом условий ипотечного договора и закона об ипотеке. По ст. 37 ФЗ № 102-ФЗ «Об ипотеке» заложенное имущество отчуждается только с согласия залогодержателя, если иное не предусмотрено договором. После полного погашения ипотеки и снятия обременения вы вправе продавать квартиру как собственник. Возможный спор с дочерью о возврате денег не делает её собственником, но может создать конфликт и претензии с её стороны.
Если дочь зарегистрирована в квартире, она как член семьи собственника имеет право пользования жилым помещением по ст. 31 ЖК РФ, если иное не установлено соглашением. Если отношения конфликтные, она совершеннолетняя, собственником не является, общего хозяйства с вами не ведёт и вы не согласны на её проживание, вопрос можно решать через суд: признавать её утратившей/не приобретшей право пользования жилым помещением и снимать с регистрационного учёта. Выселение и снятие с регистрации производятся через суд, если добровольно она не выезжает.
Обращаться в суд заранее имеет смысл, если вы не хотите её фактического вселения и постоянной регистрации в квартире. Чем дольше она фактически будет проживать, тем больше будет спор о её пользовании жильём. В иске нужно ссылаться на ст. 31 ЖК РФ, ст. 209 ГК РФ, а также на то, что дочь совершеннолетняя, доли не имеет, соглашения о проживании нет, вы как собственник против её проживания.
Сейчас для защиты прав лучше письменно уведомить дочь, что вы не согласны на её проживание и не просите её оплачивать ипотеку. В банк также можно подать заявление, что платежи по ипотеке должны производиться вами, а любые платежи третьих лиц не означают передачи им прав на квартиру. Не подписывайте с дочерью никаких расписок, соглашений или переписок, где можно истолковать оплату ипотеки как условие передачи ей квартиры.
Если хотите, могу помочь подготовить уведомление дочери, заявление в банк и иск о признании её утратившей право пользования квартирой/снятии с регистрационного учёта, чтобы заранее защитить квартиру от дальнейших претензий.