Есть ли возможность онулировать или же прекратить действие загранпаспорта

Аннулировать или прекратить действие загранпаспорта ребёнка в одностороннем порядке (без согласия бывшего супруга, который его оформил) нельзя. Загранпаспорт — это документ, удостоверяющий личность гражданина за пределами страны, и его статус регулируется законодательством РФ, в частности Федеральным законом №114-ФЗ «О порядке выезда из Российской Федерации и въезда в Российскую Федерацию». 

Основания для недействительности загранпаспорта
Согласно статье 8.1 Закона №114-ФЗ, загранпаспорт признаётся недействительным в следующих случаях:

изменение фамилии, имени, отчества, сведений о дате или месте рождения, изменение пола владельца;
истечение срока действия паспорта;
смерть владельца;
прекращение гражданства РФ;
оформление паспорта на основании поддельных документов или недостоверных сведений;
установление факта непригодности паспорта для дальнейшего использования (повреждение, износ и т. д.).
Если бывший супруг оформил загранпаспорт ребёнку в соответствии с законом, эти основания отсутствуют.

Возможности ограничения выезда ребёнка за границу
Вместо аннулирования загранпаспорта вы можете оформить запрет на выезд ребёнка за границу. Это право предоставлено каждому законному представителю несовершеннолетнего (родителю, опекуну, попечителю). 

Порядок действий:

Подать заявление в подразделение по вопросам миграции МВД по месту жительства или пребывания либо по месту жительства ребёнка. Если вы проживаете за пределами РФ, заявление подаётся в дипломатическое представительство или консульское учреждение РФ.
Приложить документы: паспорт заявителя, свидетельство о рождении ребёнка (или другой документ, подтверждающий родительские права), документ о гражданстве ребёнка.
В заявлении можно указать срок действия запрета и страны, в которые ребёнку запрещён выезд. Запрет не распространяется на выезд ребёнка в сопровождении родителя, подавшего такое заявление.
Данные о запрете вносятся в электронную систему МВД и Пограничной службы ФСБ, что препятствует выезду ребёнка за границу. 

Судебный порядок
Если бывший супруг попытается вывезти ребёнка за границу, а вы против этого, вопрос о возможности выезда может быть разрешён только в судебном порядке. Вам потребуется подать иск в районный суд по месту жительства ответчика (родителя, который хочет вывезти ребёнка). В иске нужно указать:

сведения о ребёнке;
обстоятельства, при которых возник спор;
обоснование необходимости запрета выезда (например, риски для безопасности ребёнка);
требования о признании действий бывшего супруга незаконными и запрете выезда. 
Суд будет учитывать интересы ребёнка и баланс прав родителей. Если выезд связан с лечением, учёбой или краткосрочной поездкой, суд может разрешить его, но ограничить на постоянное место жительства.

Важные нюансы
Загранпаспорт оформляет законный представитель ребёнка (родитель, усыновитель, опекун или попечитель). Если бывший супруг действовал в рамках своих полномочий, сам факт оформления паспорта без вашего согласия не является нарушением, если при этом не были нарушены другие нормы закона (например, не использовались поддельные документы). 
Запрет на выезд можно отозвать во внесудебном порядке, если это сделает родитель, который его устанавливал