Здравствуйте. Поскольку ваш контрагент — белорусский филиал российской компании, он является налоговым резидентом РФ, а не иностранной организацией. Это ключевой момент.
Обязанностей налогового агента по НДС и налогу на прибыль не возникает, так как сделка заключается между двумя российскими налоговыми резидентами.
Однако, статус «филиала» требует внимания к двум документам:
Требуйте от контрагента копию документа о постановке филиала на учет в российской налоговой инспекции (уведомление ИФНС).
Пропишите в договоре, что исполнитель (белорусский филиал) действует как российское юридическое лицо, а его юридический адрес для целей налогообложения — адрес филиала в РФ, а не адрес в Беларуси.
В этом случае НДС начисляется и уплачивается исполнителем в обычном порядке (ставка 20%), налог на прибыль удерживать не нужно. Российская организация, применяющая льготу Сколково, имеет право на освобождение от НДС (ст. 145.1 НК РФ) при условии соблюдения требований, но для безопасного применения рекомендуется подтвердить у ИФНС действие льготы в отношении сделок с ЕАЭС.
Риски и рекомендации по формулировкам в договоре:
Пропишите: «Исполнитель, действуя через белорусский филиал, является плательщиком НДС в РФ в общеустановленном порядке».
В акте выполненных работ укажите ИНН филиала (российский) и его юридический адрес в РФ.
Для минимизации рисков можно заключить договор напрямую с головной российской компанией (а не филиалом), тогда вопросов по НДС не будет вовсе.
