Здравствуйте.
Обучение в высшем командном училище МВД, которое не было завершено (3,5 года), не включается в выслугу лет во ФСИН. Для зачёта периода обучения необходимо, чтобы оно было завершено с получением документа об образовании и квалификации. Поскольку диплом не получен, этот период не может быть учтён.
Период прохождения военной службы включается в стаж службы (выслугу лет) в уголовно-исполнительной системе. Таким образом, 1 год службы в армии будет засчитан в выслугу лет во ФСИН.
Согласно Постановлению Правительства РФ от 22.09.1993 №941, в выслугу лет для назначения пенсии лицам рядового и начальствующего состава учреждений и органов уголовно-исполнительной системы засчитывается время обучения до поступления на службу в гражданских образовательных организациях высшего образования либо в профессиональных образовательных организациях в пределах пяти лет из расчёта два месяца учёбы за один месяц службы.
В вашем случае обучение в гражданском вузе началось в 1997 году, а служба во ФСИН — в 1999 году. Два года обучения до начала службы во ФСИН могут быть учтены в выслуге лет из расчёта 2 месяца учёбы за 1 месяц службы. То есть 2 года обучения будут засчитаны как 1 год выслуги лет.
Важно отметить, что это правило применяется при назначении пенсии. Если речь идёт о расчёте надбавки за выслугу лет во время службы, то порядок может регулироваться другими нормативными актами (например, Федеральным законом №197-ФЗ и Постановлением Правительства РФ №43 от 23.01.2003).