Здравствуйте!
Ребенок с 14 лет может сам выбирать место прописки, а с 16 – вообще отделиться от родителей и быть прописанным по адресу, не совпадающему с адресом прописки мамы или папы. В Вашем случае, родитель или официальный опекун может выписать ребенка даже без согласия второго родителя.
Если муж подает в суде исковое заявление о том, что ребенок проживает с ним (алименты требует или еще что-либо), Вам необходимо доказать обратное (Вы в вопросе написали "якобы она теперь проживает с ним").
Уточните свой вопрос, в чем теперь у Вас тревога, что ребенок прописан у отца, каких Вы опасаетесь последствий и с кем, действительно, фактически проживает Ваш ребенок.