Светлана, добрый день.
В Вашем случае, учитывая что аренда у физического лица, то аренда без экипажа
Согласно 642 ГК РФ:
По договору аренды транспортного средства без экипажа арендодатель предоставляет арендатору транспортное средство за плату во временное владение и пользование без оказания услуг по управлению им и его технической эксплуатации.
При этом согласно ст.226 НК РФ организация будет выступать налоговым агентом и обязана удержать НДФЛ.
Что касаемо страховых взносов, то в силу ч. 4 ст. 420 НК РФ:
4. Не признаются объектом обложения страховыми взносами выплаты и иные вознаграждения в рамках гражданско-правовых договоров, предметом которых является переход права собственности или иных вещных прав на имущество (имущественные права), и договоров, связанных с передачей в пользование имущества
В том числе с суммы аренды не исчисляется и взносы на травматизм — п. 1 ст. 20.1 Федерального закона от 24.07.1998 №125-ФЗ
Таким образом в данном случае страховых взносов не будет, необходимо удерживать только НДФЛ.
Так же хочу обратить внимание, что если вдруг Вы решите вместо аренды оформить безвозмездное пользование, то не забудьте участь как внереализационный доход — п. 8 ст. 250 НК РФ.
НДФЛ Вы уплачиваете с дохода физического лица выступая налоговым агентом.
То есть из сумм причитающихся этому физическому лицу ВЫ удерживаете НДФЛ и перечисляете в бюджет.
Патент тут не при чем.
---
Далее с дохода полученного от грузоперевозок уплачиваете налог согласно Вашей системы налогообложения.
И вот здесь Вы уже можете приобрести патент на грузоперевозки.
Стоимость патента можете рассчитать на сайте: https://patent.nalog.ru/info/
Но как указывал выше, это никак не связано с Вашей обязанностью удержать НДФЛ выступая налоговым агентом.