В соответствии с ч. 4 ст. 79 ТК РФ
В случае, когда ни одна из сторон не потребовала расторжения срочного трудового договора в связи с истечением срока его действия и работник продолжает работу после истечения срока действия трудового договора, условие о срочном характере трудового договора утрачивает силу и трудовой договор считается заключенным на неопределенный срок.
Т.е. в Вашем случае, учитывая, что после выхода основного работника на работу с Вами как временным работником, принятым на работу по срочному трудовому договору на время нахождения в декретном отпуске основного работника, договор не был расторгнут, он считается заключенным на неопределенный срок, т.к. по смыслу ч. 4 ст. 79 ТК РФ он утрачивает срочный характер.