Добрый день.
Больничный ему никто не аннулирует. Форма лечения определяется не командованием, а лечащим врачом, в связи с чем обязать лечь в госпиталь никто не может.
Указ Президента РФ от 10.11.2007 N 1495 «Об утверждении общевоинских уставов Вооруженных Сил Российской Федерации»
на этот счет отмечает
После осмотра врачом (фельдшером) заболевшие в зависимости от характера заболевания направляются для лечения в стационар (лазарет) медицинского пункта полка или военно-медицинскую организацию, а при необходимости в медицинские организации государственной или муниципальной системы здравоохранения либо им назначается лечение в амбулаторных условиях. По заключению врача медицинская помощь военнослужащим, проходящим военную службу по контракту, может оказываться на дому.
Таким образом, выбор формы лечения от командира не зависит и определяется врачом в зависимости от характера заболевания.
Следовательно приказать лечь в госпиталь командир в данном случае никак не может.
сегодня поехал писать рапорт,
В связи с чем он планировал подать рапорт?
А больничный им оформлен в военной поликлинике?