Елена, здравствуйте. Очень часто работодатели, преследуя собственные, не всегда правомерные цели, переводят бывших или принимают новых работников, оформляя фактические трудовые отношения как гражданско-правовые. Однако Вам следует знать, что если, начиная с марта месяца, Ваш трудовой функционал не изменился либо Вы подчинялись внутреннему трудовому распорядку, как и ранее (рабочее время, график работы, наличие рабочего места и пр.), то эти обстоятельства позволяют установить наличие между Вами и работодателем именно трудовых, а не гражданско-правовых отношений (которые имеют свои принципы и отличительные признаки).
Вам следует обратиться, для начала, в Прокуратуру, т.к. Инспекции по труду соответствующих регионов с введением моратория на проведение плановых и внеплановых проверок могут только выносить т.н. «предостережения» работодателям. В обращении к Прокурору обязательно указав на факт продолжительной (2.5 года) Вашей работы у данного работодателя и все сопутствующие пояснения. Обязательно укажите на Ваше положение и предстоящий отпуск по беременности и родам, т.к. эти обстоятельства важны и Прокурор может дать ГИТ соответствующее поручение на проведение проверки.
Однако лучше всего решить вопрос кардинально, обратившись в суд с заявлением об установлении факта трудовых отношений и обязании работодателя выполнить в отношении Вас все действия по социальному страхованию.