Здравствуйте.
Учитывая, что образовательное учреждение одно и у него есть подразделение, расположенное в отдельном здании вне территории этого образовательного учреждения, на мой взгляд, прием должен осуществляться по принципу, установленному ст. 67 Закона об образовании.
3. Правила приема в государственные образовательные организации субъектов Российской Федерации и муниципальные образовательные организации на обучение по основным общеобразовательным программам должны обеспечивать также прием в образовательную организацию граждан, имеющих право на получение общего образования соответствующего уровня и проживающих на территории, за которой закреплена указанная образовательная организация.
В соответствии с Приказом Минпросвещения России от 02.09.2020 N 458
5. Закрепление муниципальных образовательных организаций за конкретными территориями муниципального района, муниципального округа, городского округа осуществляется органами местного самоуправления муниципальных районов, муниципальных округов и городских округов по решению вопросов местного значения в сфере образования.
Если в правила приема внесены соответствующие изменения, которые включают территорию, где Вы проживаете, в закрепленную за данным образовательным учреждением, то распределение учащихся в рамках одного образовательного учреждения является прерогативой этого учреждения.
Об этом говорится в том же Приказе:
7. Правила приема в конкретную общеобразовательную организацию на обучение по основным общеобразовательным программам в части, не урегулированной законодательством об образовании, устанавливаются общеобразовательной организацией самостоятельно.
Прием на обучение в филиал общеобразовательной организации осуществляется в соответствии с правилами приема на обучение в общеобразовательной организации.
Безусловно, такое распределение должно учитывать место жительства учащихся и если такого учета нет, то можно обратиться сначала к директору образовательной организации с предложением перераспределить учащихся между отдельными удаленными друг от друга зданиями с учетом их территориального нахождения, а в случае, если он откажет, обратиться в соответствующий департамент с жалобой на этот отказ.
Если Вам потребуется дополнительная консультация по этому вопросу и/или составление документов, либо возникнут иные правовые вопросы, Вы можете обратиться ко мне в чат за персональной консультацией.
Вы также одновременно можете подать жалобы на отказ в принятии Вас в филиал в отдел образования Вашего района и в Прокуратуру. Они должны провести проверку по Вашим жалобам и также дать письменные ответы.
В случае, если вопрос так и не решится, к тому времени, пока органы проводят проверку по Вашим жалоба, Вам ответит уже и школа письменно. Этот отказ Вы вправе обжаловать в судебном порядке.
Можно минуя Прокуратуру и Отдел образования сразу обратиться в суд. Но, полагаю, вопрос все-же может решиться без суда.