Документы необходимые для устранения этого, отсутствуют и организации с кем были заключены эти контракты - ликвидированы

Здравствуйте, штраф должностному лицу может быть вменен только за ненадлежащее исполнение должностных обязанностей, в случае, если нарушение возникло в связи с действиями прошлого руководителя, то ответственности подлежит он. При этом у нарушений есть срок давности, если он истек, то привлечь уже не получится. Ликвидация юридических лиц, влечет прекращение всех ранее заключенных контрактов, следовательно, при наличии подтверждения, что данные юрлица ликвидированы, Вы имеете право  перевести данные контракты в прекращенные в связи с ликвидацией подрядчика. Разместите соответствующую информацию в ЕИС.