С чего начать, что бы начать разбирательство?

А зачем Вам разбирательство по переработке?

В таком случае, Вы вправе подать рапорт о неправомерных действиях на основании  ст. 106-112 ДУ ВС  и требовать в отношении указанного лица провести разбирательство по факту совершения им дисциплинарного проступка (как минимум), который заключается в том, что он в нарушении регламента служебного времени, который утвержден приказом командира в/части, требует от подчиненных находиться на службе

Кроме того, можете обратиться в ВСО с заявлением о своершении им преступления, предусмотренного ст. 286 УК РФ

УК РФ Статья 286. Превышение должностных полномочий
 

 
1. Совершение должностным лицом действий, явно выходящих за пределы его полномочий и повлекших существенное нарушение прав и законных интересов граждан или организаций либо охраняемых законом интересов общества или государства