Когда мне лучше подать это заявление?

Это решает военно-врачебная комиссия (ВВК) Там целая Графа расписания болезней, откуда я знаю, я не врач, а юрист, может Вас вообще признают НЕ годным, категория «Д» для военной службы с таким заболеванием.

КОММЕНТАРИЙ К ФЕДЕРАЛЬНОМУ ЗАКОНУ ОТ 25 ИЮЛЯ 2002 Г.
N 113-ФЗ «ОБ АЛЬТЕРНАТИВНОЙ ГРАЖДАНСКОЙ СЛУЖБЕ»

(Постатейный)

Материал подготовлен с использованием правовых актов
по состоянию на 4 июня 2014 года

Е.В. ИОНОВА
Медицинское освидетельствование граждан, направляемых на альтернативную гражданскую службу, осуществляется в том же порядке, что определен для граждан, подлежащих призыву на военную службу. Согласно п. 1 ст. 5.1 ФЗ «О воинской обязанности и военной службе» граждане при постановке на воинский учет, призыве или поступлении на военную службу по контракту, поступлении в мобилизационный людской резерв, поступлении в военные профессиональные образовательные организации и военные образовательные организации высшего образования, призыве на военные сборы, а также граждане, ранее признанные ограниченно годными к военной службе по состоянию здоровья, проходят медицинское освидетельствование врачами-специалистами:
— терапевтом;
— хирургом;
— невропатологом;
— психиатром;
— окулистом;
— оториноларингологом;
— стоматологом;
— в случае необходимости — врачами других специальностей.
Порядок организации и проведения медицинского освидетельствования граждан, подлежащих призыву на военную службу, определяется Положением о военно-врачебной экспертизе, утвержденным Постановлением Правительства РФ от 04.07.2013 N 565.
Врачи, руководящие работой по медицинскому освидетельствованию граждан, по результатам медицинского освидетельствования дают заключение о годности к военной службе по следующим категориям:
— А — годен к военной службе;
— Б — годен к военной службе с незначительными ограничениями;
— В — ограниченно годен к военной службе;
— Г — временно не годен к военной службе;
— Д — не годен к военной службе.