Могу ли я как самозанятый работать с иностранной компанией по их договору и получать ежемесячные фиксированые выплаты?

В таком случае, что я должен указывать при оплате налога ( занимаюсь разработкой ПО )?

При оплате налогов указываете сумму полученной оплаты. Если оплата в валюте — конвертируете в рубли по курсу ЦБ с обязанностью продать в банке 80% валютной выручки с момента получения оплаты на счет в уполномоченном банке 

И что я должен держать на готове при возникновении вопросов у банка?

Договор, инвойсы, акты выполненных работ( в зависимости от условий договора)

Сегодня БР опубликовал Письмо от 28.02.2022 N ИН-019-12/18( к сожалению с таким вот опозданием)

1. Под резидентами — участниками внешнеэкономической деятельности, обязанными осуществить продажу валютной выручки, понимаются юридические лица (за исключением кредитных организаций и государственной корпорации развития «ВЭБ.РФ»), физические лица, являющиеся индивидуальными предпринимателями или лицами, занимающимися в установленном законодательством Российской Федерации порядке частной практикой (далее — резидент).

В связи с чем физ.лица продавать вал.выручку не обязаны