Но, если она не соотвнтствовала норма закона на момент ввоза, почему растаможили?

Сергей, добрый вечер.

А чем ГИБДД мотивировало отказ в постановке на учет? Вам выдали письменный отказ?

Дело в том, что в силу приказа МВД России от 21.12.2019 N 950 отказ должен быть оформлен письменно на поданном заявлении о регистрации транспортного средства.

При этом в ст. 20 ФЗ  от 03.08.2018 N 283-ФЗ «О государственной регистрации транспортных средств в Российской Федерации и о внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации» содержится исчерпывающий перечень оснований для отказа в постановке транспортного средства на учет, среди которых называются:

1. Запрещается совершение регистрационных действий:
4) в случае несоответствия регистрационных данных или конструкции транспортного средства сведениям, указанным в документах, идентифицирующих транспортное средство, за исключением регистрационных и иных данных транспортного средства, подлежащих изменению (внесению в документ, идентифицирующий транспортное средство) на основании представленных документов;

Из Вашего вопроса следует, что конструкция транспортного средства не соответствует сведениям указанным в ПТС.

В ПТС какой класс заявлен?

Добрый день, Сергей!

Собственно говоря, согласно положений подпунктов «5» и «7» ч.1 ст. 261 ТК ЕАЭС, при подаче ПТД Вы должны были приложить 

 документы, подтверждающие соблюдение условий ввоза с освобождением от уплаты таможенных пошлин, налогов (свидетельство участника Программы)

и

документы, содержащие сведения, позволяющие идентифицировать транспортное средство для личного пользования (достаточно иностранного ПТС)

Поэтому ТС и выпустили спокойно. 

Электронные паспорта транспортных средств в настоящее время таможенные органы не выдают 

(Решение Коллегии Евразийской экономической комиссии от 22.09.2015 N 122 «Об утверждении Порядка функционирования систем электронных паспортов транспортных средств (электронных паспортов шасси транспортных средств) и электронных паспортов самоходных машин и других видов техники»)

Поэтому, если у них не возникло вопросов по документам, приложенным к ПТД, то они спокойно выпустили товар. Задерживать они его просто не могут. И экологический класс проверять не обязаны. 

Если Вас интересует порядок дальнейших действий, то Вы можете обратиться ко мне в чат.

Таможенное оформление и внешнеэкономическая деятельность — моя специализация.

Удачи!