"Адресуемая с использованием домена информационная система применяется для получения от третьих лиц

Но не понятно, можно ли вернуть домен каким то иным путем, потому что то, что он выпал на 2 недели из индекса это критично.

Артем Малеев

Указанные правила предусматривают восстановление делегирования домена, только если основания прекращения устранены:

5.7…
Регистратор восстанавливает делегирование в установленном договором порядке после устранения причины прекращения делегирования.

Но, опять же, хотелось бы понимать, в чём могло быть нарушение — что было на сайте. 

И видеть обращение ЦБ.

Регистратор должен был Вам его предоставить:

При получении обращения регистратор обязан направить администратору уведомление с приложением текста обращения и, при необходимости, запросить у администратора документы, подтверждающие хранящуюся в Реестре информацию, предназначенную для идентификации администратора.

Как нам решить данную проблему, сейчас наш юрист отправил запросы

Могли бы уточнить — куда были направлены запросы — регистратору и ЦБ?

он выпал на 2 недели из индекса это критично

Если того, на что ссылались ЦБ и регистратор на самом деле на сайте не было, то можно говорить и причинении убытков, в том числе в виде упущенной выгоды:

Статья 15 ГК РФ Возмещение убытков

1. Лицо, право которого нарушено, может требовать полного возмещения причиненных ему убытков, если законом или договором не предусмотрено возмещение убытков в меньшем размере.
2. Под убытками понимаются расходы, которые лицо, чье право нарушено, произвело или должно будет произвести для восстановления нарушенного права, утрата или повреждение его имущества (реальный ущерб), а также неполученные доходы, которые это лицо получило бы при обычных условиях гражданского оборота, если бы его право не было нарушено (упущенная выгода).

Желательно ещё и договор с регистратором видеть — он может быть опубликован в виде публичной оферты на сайте.

Там может быть детализирована и процедура прекращения делегирования домена и процедура его восстановления.